Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lin52Q8CD94 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lin52Q8CD94 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lin52Q8CD94 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lin52Q8CD94 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lin52Q8CD94 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms