Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB49

Tprg1, Tumor protein p63-regulated gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tprg1Q8CB49 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tprg1Q8CB49 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tprg1Q8CB49 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tprg1Q8CB49 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tprg1Q8CB49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tprg1Q8CB49 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tprg1Q8CB49 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tprg1Q8CB49 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms