Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strip2Q8C9H6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Strip2Q8C9H6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Strip2Q8C9H6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Strip2Q8C9H6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strip2Q8C9H6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strip2Q8C9H6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Strip2Q8C9H6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strip2Q8C9H6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strip2Q8C9H6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strip2Q8C9H6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Strip2Q8C9H6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strip2Q8C9H6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip2Q8C9H6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip2Q8C9H6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip2Q8C9H6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strip2Q8C9H6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Strip2Q8C9H6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strip2Q8C9H6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms