Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FarsaQ8C0C7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FarsaQ8C0C7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FarsaQ8C0C7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FarsaQ8C0C7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FarsaQ8C0C7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FarsaQ8C0C7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms