Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx16Q8C080 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx16Q8C080 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx16Q8C080 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx16Q8C080 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx16Q8C080 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms