Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp5Q8BX09 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp5Q8BX09 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp5Q8BX09 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbbp5Q8BX09 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbbp5Q8BX09 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp5Q8BX09 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp5Q8BX09 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp5Q8BX09 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp5Q8BX09 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp5Q8BX09 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp5Q8BX09 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp5Q8BX09 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms