Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rps6kb1Q8BSK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6kb1Q8BSK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rps6kb1Q8BSK8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6kb1Q8BSK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rps6kb1Q8BSK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rps6kb1Q8BSK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rps6kb1Q8BSK8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6kb1Q8BSK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6kb1Q8BSK8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6kb1Q8BSK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rps6kb1Q8BSK8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rps6kb1Q8BSK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rps6kb1Q8BSK8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rps6kb1Q8BSK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rps6kb1Q8BSK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6kb1Q8BSK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6kb1Q8BSK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6kb1Q8BSK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6kb1Q8BSK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6kb1Q8BSK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rps6kb1Q8BSK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rps6kb1Q8BSK8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rps6kb1Q8BSK8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rps6kb1Q8BSK8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rps6kb1Q8BSK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rps6kb1Q8BSK8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rps6kb1Q8BSK8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rps6kb1Q8BSK8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rps6kb1Q8BSK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rps6kb1Q8BSK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rps6kb1Q8BSK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rps6kb1Q8BSK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rps6kb1Q8BSK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rps6kb1Q8BSK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rps6kb1Q8BSK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rps6kb1Q8BSK8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rps6kb1Q8BSK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms