Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sdhaf3Q8BQU3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdhaf3Q8BQU3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdhaf3Q8BQU3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdhaf3Q8BQU3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sdhaf3Q8BQU3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdhaf3Q8BQU3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms