Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dupd1Q8BK84 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dupd1Q8BK84 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dupd1Q8BK84 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dupd1Q8BK84 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dupd1Q8BK84 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dupd1Q8BK84 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dupd1Q8BK84 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dupd1Q8BK84 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dupd1Q8BK84 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dupd1Q8BK84 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dupd1Q8BK84 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dupd1Q8BK84 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dupd1Q8BK84 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dupd1Q8BK84 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dupd1Q8BK84 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dupd1Q8BK84 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dupd1Q8BK84 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dupd1Q8BK84 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dupd1Q8BK84 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dupd1Q8BK84 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dupd1Q8BK84 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dupd1Q8BK84 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dupd1Q8BK84 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dupd1Q8BK84 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms