Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl1Q8BH66 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atl1Q8BH66 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl1Q8BH66 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl1Q8BH66 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl1Q8BH66 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl1Q8BH66 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atl1Q8BH66 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atl1Q8BH66 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atl1Q8BH66 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atl1Q8BH66 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atl1Q8BH66 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atl1Q8BH66 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl1Q8BH66 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl1Q8BH66 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms