Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmtc4Q8BG19 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmtc4Q8BG19 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc4Q8BG19 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmtc4Q8BG19 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmtc4Q8BG19 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmtc4Q8BG19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmtc4Q8BG19 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms