Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cracr2bQ80ZJ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cracr2bQ80ZJ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cracr2bQ80ZJ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cracr2bQ80ZJ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cracr2bQ80ZJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cracr2bQ80ZJ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cracr2bQ80ZJ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cracr2bQ80ZJ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cracr2bQ80ZJ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cracr2bQ80ZJ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cracr2bQ80ZJ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cracr2bQ80ZJ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cracr2bQ80ZJ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cracr2bQ80ZJ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cracr2bQ80ZJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cracr2bQ80ZJ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cracr2bQ80ZJ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cracr2bQ80ZJ8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cracr2bQ80ZJ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cracr2bQ80ZJ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cracr2bQ80ZJ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms