Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkhd1l1Q80ZA4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkhd1l1Q80ZA4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkhd1l1Q80ZA4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkhd1l1Q80ZA4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkhd1l1Q80ZA4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkhd1l1Q80ZA4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkhd1l1Q80ZA4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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