Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cdc42bpbQ7TT50 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cdc42bpbQ7TT50 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cdc42bpbQ7TT50 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cdc42bpbQ7TT50 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cdc42bpbQ7TT50 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Cdc42bpbQ7TT50 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cdc42bpbQ7TT50 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cdc42bpbQ7TT50 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cdc42bpbQ7TT50 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cdc42bpbQ7TT50 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cdc42bpbQ7TT50 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cdc42bpbQ7TT50 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cdc42bpbQ7TT50 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cdc42bpbQ7TT50 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cdc42bpbQ7TT50 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cdc42bpbQ7TT50 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cdc42bpbQ7TT50 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cdc42bpbQ7TT50 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cdc42bpbQ7TT50 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cdc42bpbQ7TT50 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cdc42bpbQ7TT50 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cdc42bpbQ7TT50 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cdc42bpbQ7TT50 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cdc42bpbQ7TT50 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cdc42bpbQ7TT50 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cdc42bpbQ7TT50 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Cdc42bpbQ7TT50 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cdc42bpbQ7TT50 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cdc42bpbQ7TT50 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cdc42bpbQ7TT50 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cdc42bpbQ7TT50 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cdc42bpbQ7TT50 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cdc42bpbQ7TT50 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cdc42bpbQ7TT50 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Cdc42bpbQ7TT50 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cdc42bpbQ7TT50 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cdc42bpbQ7TT50 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cdc42bpbQ7TT50 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cdc42bpbQ7TT50 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cdc42bpbQ7TT50 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cdc42bpbQ7TT50 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cdc42bpbQ7TT50 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Cdc42bpbQ7TT50 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cdc42bpbQ7TT50 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cdc42bpbQ7TT50 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Cdc42bpbQ7TT50 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cdc42bpbQ7TT50 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cdc42bpbQ7TT50 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Cdc42bpbQ7TT50 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cdc42bpbQ7TT50 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cdc42bpbQ7TT50 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cdc42bpbQ7TT50 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cdc42bpbQ7TT50 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cdc42bpbQ7TT50 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cdc42bpbQ7TT50 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cdc42bpbQ7TT50 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cdc42bpbQ7TT50 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Cdc42bpbQ7TT50 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cdc42bpbQ7TT50 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cdc42bpbQ7TT50 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Cdc42bpbQ7TT50 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cdc42bpbQ7TT50 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cdc42bpbQ7TT50 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cdc42bpbQ7TT50 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cdc42bpbQ7TT50 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cdc42bpbQ7TT50 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cdc42bpbQ7TT50 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Cdc42bpbQ7TT50 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cdc42bpbQ7TT50 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cdc42bpbQ7TT50 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cdc42bpbQ7TT50 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cdc42bpbQ7TT50 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms