Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Prrc2bQ7TPM1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Prrc2bQ7TPM1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Prrc2bQ7TPM1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Prrc2bQ7TPM1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Prrc2bQ7TPM1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Prrc2bQ7TPM1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Prrc2bQ7TPM1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Prrc2bQ7TPM1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Prrc2bQ7TPM1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Prrc2bQ7TPM1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Prrc2bQ7TPM1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Prrc2bQ7TPM1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Prrc2bQ7TPM1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Prrc2bQ7TPM1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Prrc2bQ7TPM1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Prrc2bQ7TPM1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Prrc2bQ7TPM1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Prrc2bQ7TPM1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Prrc2bQ7TPM1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Prrc2bQ7TPM1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Prrc2bQ7TPM1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Prrc2bQ7TPM1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Prrc2bQ7TPM1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Prrc2bQ7TPM1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Prrc2bQ7TPM1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Prrc2bQ7TPM1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Prrc2bQ7TPM1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Prrc2bQ7TPM1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Prrc2bQ7TPM1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Prrc2bQ7TPM1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Prrc2bQ7TPM1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Prrc2bQ7TPM1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Prrc2bQ7TPM1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Prrc2bQ7TPM1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Prrc2bQ7TPM1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Prrc2bQ7TPM1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Prrc2bQ7TPM1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Prrc2bQ7TPM1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Prrc2bQ7TPM1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Prrc2bQ7TPM1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Prrc2bQ7TPM1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Prrc2bQ7TPM1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Prrc2bQ7TPM1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Prrc2bQ7TPM1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Prrc2bQ7TPM1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Prrc2bQ7TPM1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Prrc2bQ7TPM1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Prrc2bQ7TPM1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Prrc2bQ7TPM1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Prrc2bQ7TPM1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Prrc2bQ7TPM1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Prrc2bQ7TPM1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Prrc2bQ7TPM1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms