Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS8

Epop, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpopQ7TNS8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
EpopQ7TNS8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EpopQ7TNS8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EpopQ7TNS8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EpopQ7TNS8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpopQ7TNS8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EpopQ7TNS8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms