Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
March6Q6ZQ89 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
March6Q6ZQ89 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
March6Q6ZQ89 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
March6Q6ZQ89 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
March6Q6ZQ89 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
March6Q6ZQ89 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms