Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc82Q6PG04 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc82Q6PG04 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc82Q6PG04 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc82Q6PG04 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc82Q6PG04 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc82Q6PG04 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc82Q6PG04 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc82Q6PG04 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc82Q6PG04 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc82Q6PG04 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc82Q6PG04 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc82Q6PG04 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms