Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmeff1Q6PFE7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmeff1Q6PFE7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmeff1Q6PFE7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmeff1Q6PFE7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmeff1Q6PFE7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmeff1Q6PFE7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmeff1Q6PFE7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmeff1Q6PFE7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmeff1Q6PFE7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmeff1Q6PFE7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmeff1Q6PFE7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmeff1Q6PFE7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmeff1Q6PFE7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmeff1Q6PFE7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmeff1Q6PFE7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmeff1Q6PFE7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmeff1Q6PFE7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms