Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Tmeff1Q6PFE7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Tmeff1Q6PFE7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Tmeff1Q6PFE7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Tmeff1Q6PFE7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Tmeff1Q6PFE7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Tmeff1Q6PFE7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tmeff1Q6PFE7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Tmeff1Q6PFE7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Tmeff1Q6PFE7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tmeff1Q6PFE7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tmeff1Q6PFE7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Tmeff1Q6PFE7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Tmeff1Q6PFE7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tmeff1Q6PFE7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Tmeff1Q6PFE7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tmeff1Q6PFE7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tmeff1Q6PFE7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmeff1Q6PFE7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tmeff1Q6PFE7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tmeff1Q6PFE7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tmeff1Q6PFE7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tmeff1Q6PFE7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tmeff1Q6PFE7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tmeff1Q6PFE7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Tmeff1Q6PFE7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tmeff1Q6PFE7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tmeff1Q6PFE7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tmeff1Q6PFE7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tmeff1Q6PFE7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tmeff1Q6PFE7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tmeff1Q6PFE7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Tmeff1Q6PFE7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmeff1Q6PFE7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tmeff1Q6PFE7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmeff1Q6PFE7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tmeff1Q6PFE7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tmeff1Q6PFE7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tmeff1Q6PFE7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmeff1Q6PFE7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmeff1Q6PFE7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmeff1Q6PFE7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmeff1Q6PFE7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmeff1Q6PFE7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmeff1Q6PFE7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmeff1Q6PFE7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmeff1Q6PFE7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmeff1Q6PFE7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmeff1Q6PFE7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmeff1Q6PFE7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmeff1Q6PFE7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tmeff1Q6PFE7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmeff1Q6PFE7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmeff1Q6PFE7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmeff1Q6PFE7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmeff1Q6PFE7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmeff1Q6PFE7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmeff1Q6PFE7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmeff1Q6PFE7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmeff1Q6PFE7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmeff1Q6PFE7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmeff1Q6PFE7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmeff1Q6PFE7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmeff1Q6PFE7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmeff1Q6PFE7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmeff1Q6PFE7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmeff1Q6PFE7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmeff1Q6PFE7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmeff1Q6PFE7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmeff1Q6PFE7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmeff1Q6PFE7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmeff1Q6PFE7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmeff1Q6PFE7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmeff1Q6PFE7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmeff1Q6PFE7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmeff1Q6PFE7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmeff1Q6PFE7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmeff1Q6PFE7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmeff1Q6PFE7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmeff1Q6PFE7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmeff1Q6PFE7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmeff1Q6PFE7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmeff1Q6PFE7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmeff1Q6PFE7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmeff1Q6PFE7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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