Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CtifQ6PEE2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CtifQ6PEE2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CtifQ6PEE2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CtifQ6PEE2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CtifQ6PEE2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtifQ6PEE2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtifQ6PEE2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtifQ6PEE2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CtifQ6PEE2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CtifQ6PEE2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CtifQ6PEE2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CtifQ6PEE2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CtifQ6PEE2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtifQ6PEE2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CtifQ6PEE2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms