Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarcc2Q6PDG5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarcc2Q6PDG5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarcc2Q6PDG5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarcc2Q6PDG5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarcc2Q6PDG5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarcc2Q6PDG5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarcc2Q6PDG5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarcc2Q6PDG5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarcc2Q6PDG5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarcc2Q6PDG5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarcc2Q6PDG5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarcc2Q6PDG5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarcc2Q6PDG5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarcc2Q6PDG5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarcc2Q6PDG5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarcc2Q6PDG5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarcc2Q6PDG5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarcc2Q6PDG5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarcc2Q6PDG5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarcc2Q6PDG5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarcc2Q6PDG5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarcc2Q6PDG5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarcc2Q6PDG5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarcc2Q6PDG5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarcc2Q6PDG5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarcc2Q6PDG5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarcc2Q6PDG5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarcc2Q6PDG5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarcc2Q6PDG5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarcc2Q6PDG5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarcc2Q6PDG5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarcc2Q6PDG5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarcc2Q6PDG5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcc2Q6PDG5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcc2Q6PDG5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarcc2Q6PDG5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarcc2Q6PDG5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarcc2Q6PDG5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarcc2Q6PDG5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcc2Q6PDG5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarcc2Q6PDG5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarcc2Q6PDG5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarcc2Q6PDG5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms