Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mfsd4aQ6PDC8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mfsd4aQ6PDC8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd4aQ6PDC8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd4aQ6PDC8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mfsd4aQ6PDC8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms