Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Trak1Q6PD31 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Trak1Q6PD31 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Trak1Q6PD31 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trak1Q6PD31 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trak1Q6PD31 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Trak1Q6PD31 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trak1Q6PD31 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trak1Q6PD31 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trak1Q6PD31 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Trak1Q6PD31 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Trak1Q6PD31 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Trak1Q6PD31 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trak1Q6PD31 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trak1Q6PD31 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trak1Q6PD31 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trak1Q6PD31 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trak1Q6PD31 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Trak1Q6PD31 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Trak1Q6PD31 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Trak1Q6PD31 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trak1Q6PD31 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Trak1Q6PD31 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Trak1Q6PD31 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trak1Q6PD31 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trak1Q6PD31 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Trak1Q6PD31 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trak1Q6PD31 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trak1Q6PD31 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Trak1Q6PD31 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Trak1Q6PD31 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Trak1Q6PD31 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Trak1Q6PD31 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Trak1Q6PD31 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Trak1Q6PD31 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Trak1Q6PD31 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trak1Q6PD31 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trak1Q6PD31 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trak1Q6PD31 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trak1Q6PD31 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trak1Q6PD31 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trak1Q6PD31 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Trak1Q6PD31 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Trak1Q6PD31 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trak1Q6PD31 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Trak1Q6PD31 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Trak1Q6PD31 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Trak1Q6PD31 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trak1Q6PD31 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Trak1Q6PD31 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trak1Q6PD31 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Trak1Q6PD31 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trak1Q6PD31 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms