Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ3

Garem2, GRB2-associated and regulator of MAPK protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem2Q6PAJ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Garem2Q6PAJ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Garem2Q6PAJ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Garem2Q6PAJ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Garem2Q6PAJ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Garem2Q6PAJ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Garem2Q6PAJ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Garem2Q6PAJ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Garem2Q6PAJ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Garem2Q6PAJ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Garem2Q6PAJ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Garem2Q6PAJ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Garem2Q6PAJ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Garem2Q6PAJ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Garem2Q6PAJ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Garem2Q6PAJ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Garem2Q6PAJ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Garem2Q6PAJ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Garem2Q6PAJ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Garem2Q6PAJ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Garem2Q6PAJ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Garem2Q6PAJ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Garem2Q6PAJ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Garem2Q6PAJ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Garem2Q6PAJ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Garem2Q6PAJ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Garem2Q6PAJ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Garem2Q6PAJ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Garem2Q6PAJ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Garem2Q6PAJ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Garem2Q6PAJ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Garem2Q6PAJ3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Garem2Q6PAJ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Garem2Q6PAJ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Garem2Q6PAJ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Garem2Q6PAJ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Garem2Q6PAJ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Garem2Q6PAJ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms