Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cpa4Q6P8K8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cpa4Q6P8K8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cpa4Q6P8K8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cpa4Q6P8K8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cpa4Q6P8K8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cpa4Q6P8K8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpa4Q6P8K8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpa4Q6P8K8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpa4Q6P8K8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpa4Q6P8K8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpa4Q6P8K8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpa4Q6P8K8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpa4Q6P8K8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpa4Q6P8K8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpa4Q6P8K8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpa4Q6P8K8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cpa4Q6P8K8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpa4Q6P8K8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpa4Q6P8K8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cpa4Q6P8K8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cpa4Q6P8K8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cpa4Q6P8K8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpa4Q6P8K8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpa4Q6P8K8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpa4Q6P8K8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpa4Q6P8K8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cpa4Q6P8K8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpa4Q6P8K8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cpa4Q6P8K8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms