Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrnp200Q6P4T2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp200Q6P4T2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp200Q6P4T2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrnp200Q6P4T2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrnp200Q6P4T2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrnp200Q6P4T2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrnp200Q6P4T2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrnp200Q6P4T2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp200Q6P4T2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp200Q6P4T2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp200Q6P4T2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrnp200Q6P4T2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrnp200Q6P4T2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrnp200Q6P4T2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp200Q6P4T2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp200Q6P4T2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp200Q6P4T2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp200Q6P4T2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrnp200Q6P4T2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrnp200Q6P4T2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrnp200Q6P4T2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrnp200Q6P4T2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrnp200Q6P4T2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrnp200Q6P4T2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms