Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5416Q6IE28 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5416Q6IE28 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5416Q6IE28 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5416Q6IE28 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5416Q6IE28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5416Q6IE28 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5416Q6IE28 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms