Protein–RNA interactions for Protein: Q64522

Hist2h2ab, Histone H2A type 2-B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2abQ64522 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hist2h2abQ64522 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hist2h2abQ64522 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hist2h2abQ64522 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hist2h2abQ64522 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist2h2abQ64522 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist2h2abQ64522 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hist2h2abQ64522 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hist2h2abQ64522 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2abQ64522 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2abQ64522 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2abQ64522 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2abQ64522 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2abQ64522 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist2h2abQ64522 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist2h2abQ64522 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms