Protein–RNA interactions for Protein: Q64522

Hist2h2ab, Histone H2A type 2-B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2abQ64522 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Hist2h2abQ64522 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hist2h2abQ64522 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hist2h2abQ64522 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hist2h2abQ64522 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hist2h2abQ64522 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hist2h2abQ64522 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Hist2h2abQ64522 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Hist2h2abQ64522 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hist2h2abQ64522 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Hist2h2abQ64522 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hist2h2abQ64522 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hist2h2abQ64522 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Hist2h2abQ64522 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hist2h2abQ64522 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hist2h2abQ64522 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hist2h2abQ64522 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hist2h2abQ64522 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hist2h2abQ64522 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hist2h2abQ64522 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hist2h2abQ64522 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hist2h2abQ64522 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hist2h2abQ64522 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hist2h2abQ64522 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hist2h2abQ64522 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hist2h2abQ64522 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hist2h2abQ64522 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hist2h2abQ64522 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Hist2h2abQ64522 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hist2h2abQ64522 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hist2h2abQ64522 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hist2h2abQ64522 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hist2h2abQ64522 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hist2h2abQ64522 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hist2h2abQ64522 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hist2h2abQ64522 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hist2h2abQ64522 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hist2h2abQ64522 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hist2h2abQ64522 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hist2h2abQ64522 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hist2h2abQ64522 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hist2h2abQ64522 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hist2h2abQ64522 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hist2h2abQ64522 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hist2h2abQ64522 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Hist2h2abQ64522 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hist2h2abQ64522 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hist2h2abQ64522 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hist2h2abQ64522 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hist2h2abQ64522 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hist2h2abQ64522 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hist2h2abQ64522 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hist2h2abQ64522 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hist2h2abQ64522 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hist2h2abQ64522 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hist2h2abQ64522 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hist2h2abQ64522 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hist2h2abQ64522 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hist2h2abQ64522 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hist2h2abQ64522 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hist2h2abQ64522 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hist2h2abQ64522 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hist2h2abQ64522 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hist2h2abQ64522 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hist2h2abQ64522 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hist2h2abQ64522 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hist2h2abQ64522 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hist2h2abQ64522 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hist2h2abQ64522 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hist2h2abQ64522 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hist2h2abQ64522 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hist2h2abQ64522 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hist2h2abQ64522 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hist2h2abQ64522 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hist2h2abQ64522 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hist2h2abQ64522 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hist2h2abQ64522 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hist2h2abQ64522 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hist2h2abQ64522 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hist2h2abQ64522 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hist2h2abQ64522 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hist2h2abQ64522 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hist2h2abQ64522 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hist2h2abQ64522 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hist2h2abQ64522 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hist2h2abQ64522 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hist2h2abQ64522 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hist2h2abQ64522 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hist2h2abQ64522 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hist2h2abQ64522 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hist2h2abQ64522 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hist2h2abQ64522 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hist2h2abQ64522 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hist2h2abQ64522 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hist2h2abQ64522 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hist2h2abQ64522 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hist2h2abQ64522 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hist2h2abQ64522 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hist2h2abQ64522 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hist2h2abQ64522 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms