Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SypQ62277 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SypQ62277 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SypQ62277 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SypQ62277 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SypQ62277 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SypQ62277 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SypQ62277 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SypQ62277 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SypQ62277 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SypQ62277 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SypQ62277 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SypQ62277 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SypQ62277 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SypQ62277 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SypQ62277 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SypQ62277 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SypQ62277 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SypQ62277 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SypQ62277 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SypQ62277 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SypQ62277 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SypQ62277 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SypQ62277 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SypQ62277 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SypQ62277 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SypQ62277 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SypQ62277 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SypQ62277 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SypQ62277 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SypQ62277 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SypQ62277 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SypQ62277 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SypQ62277 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SypQ62277 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SypQ62277 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SypQ62277 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SypQ62277 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SypQ62277 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SypQ62277 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SypQ62277 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SypQ62277 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SypQ62277 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SypQ62277 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SypQ62277 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SypQ62277 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SypQ62277 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SypQ62277 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SypQ62277 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SypQ62277 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SypQ62277 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SypQ62277 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SypQ62277 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SypQ62277 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SypQ62277 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SypQ62277 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SypQ62277 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SypQ62277 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SypQ62277 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SypQ62277 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SypQ62277 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SypQ62277 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SypQ62277 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SypQ62277 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SypQ62277 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SypQ62277 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SypQ62277 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SypQ62277 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SypQ62277 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SypQ62277 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SypQ62277 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SypQ62277 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SypQ62277 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SypQ62277 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SypQ62277 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SypQ62277 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SypQ62277 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SypQ62277 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SypQ62277 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SypQ62277 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SypQ62277 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SypQ62277 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SypQ62277 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SypQ62277 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SypQ62277 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SypQ62277 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SypQ62277 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SypQ62277 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SypQ62277 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SypQ62277 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SypQ62277 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SypQ62277 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SypQ62277 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SypQ62277 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SypQ62277 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SypQ62277 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SypQ62277 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SypQ62277 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SypQ62277 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SypQ62277 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms