Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sprr1bQ62267 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sprr1bQ62267 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sprr1bQ62267 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sprr1bQ62267 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms