Protein–RNA interactions for Protein: Q61142

Spin1, Spindlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin1Q61142 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spin1Q61142 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Spin1Q61142 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin1Q61142 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spin1Q61142 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spin1Q61142 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spin1Q61142 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spin1Q61142 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spin1Q61142 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spin1Q61142 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms