Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prpf4bQ61136 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prpf4bQ61136 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prpf4bQ61136 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prpf4bQ61136 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prpf4bQ61136 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prpf4bQ61136 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prpf4bQ61136 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prpf4bQ61136 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prpf4bQ61136 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prpf4bQ61136 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prpf4bQ61136 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prpf4bQ61136 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prpf4bQ61136 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms