Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp7Q60973 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp7Q60973 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp7Q60973 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp7Q60973 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp7Q60973 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbbp7Q60973 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rbbp7Q60973 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp7Q60973 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp7Q60973 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp7Q60973 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp7Q60973 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp7Q60973 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp7Q60973 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp7Q60973 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp7Q60973 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp7Q60973 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp7Q60973 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms