Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk1Q60855 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ripk1Q60855 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk1Q60855 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk1Q60855 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk1Q60855 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk1Q60855 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk1Q60855 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk1Q60855 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk1Q60855 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk1Q60855 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk1Q60855 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk1Q60855 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk1Q60855 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk1Q60855 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms