Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Samhd1Q60710 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Samhd1Q60710 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Samhd1Q60710 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Samhd1Q60710 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samhd1Q60710 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Samhd1Q60710 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Samhd1Q60710 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Samhd1Q60710 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Samhd1Q60710 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Samhd1Q60710 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Samhd1Q60710 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Samhd1Q60710 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Samhd1Q60710 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Samhd1Q60710 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Samhd1Q60710 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Samhd1Q60710 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Samhd1Q60710 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Samhd1Q60710 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Samhd1Q60710 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Samhd1Q60710 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samhd1Q60710 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Samhd1Q60710 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Samhd1Q60710 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Samhd1Q60710 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Samhd1Q60710 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Samhd1Q60710 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Samhd1Q60710 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms