Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HnrnpdQ60668 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HnrnpdQ60668 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HnrnpdQ60668 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HnrnpdQ60668 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HnrnpdQ60668 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HnrnpdQ60668 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HnrnpdQ60668 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HnrnpdQ60668 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HnrnpdQ60668 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HnrnpdQ60668 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HnrnpdQ60668 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HnrnpdQ60668 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HnrnpdQ60668 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HnrnpdQ60668 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HnrnpdQ60668 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms