Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl17Q5UW37 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl17Q5UW37 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl17Q5UW37 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl17Q5UW37 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxcl17Q5UW37 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxcl17Q5UW37 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcl17Q5UW37 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcl17Q5UW37 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxcl17Q5UW37 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxcl17Q5UW37 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl17Q5UW37 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cxcl17Q5UW37 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cxcl17Q5UW37 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cxcl17Q5UW37 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcl17Q5UW37 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxcl17Q5UW37 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxcl17Q5UW37 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcl17Q5UW37 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cxcl17Q5UW37 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cxcl17Q5UW37 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxcl17Q5UW37 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcl17Q5UW37 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcl17Q5UW37 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl17Q5UW37 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl17Q5UW37 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl17Q5UW37 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl17Q5UW37 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl17Q5UW37 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl17Q5UW37 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcl17Q5UW37 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cxcl17Q5UW37 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms