Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lhfpl4Q5U4E0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lhfpl4Q5U4E0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhfpl4Q5U4E0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lhfpl4Q5U4E0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms