Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms