Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rapgef6Q5NCJ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Rapgef6Q5NCJ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rapgef6Q5NCJ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rapgef6Q5NCJ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rapgef6Q5NCJ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Rapgef6Q5NCJ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rapgef6Q5NCJ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rapgef6Q5NCJ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rapgef6Q5NCJ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rapgef6Q5NCJ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rapgef6Q5NCJ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rapgef6Q5NCJ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rapgef6Q5NCJ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rapgef6Q5NCJ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rapgef6Q5NCJ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rapgef6Q5NCJ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rapgef6Q5NCJ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rapgef6Q5NCJ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rapgef6Q5NCJ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rapgef6Q5NCJ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rapgef6Q5NCJ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rapgef6Q5NCJ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rapgef6Q5NCJ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rapgef6Q5NCJ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rapgef6Q5NCJ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rapgef6Q5NCJ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rapgef6Q5NCJ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Rapgef6Q5NCJ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Rapgef6Q5NCJ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rapgef6Q5NCJ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rapgef6Q5NCJ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rapgef6Q5NCJ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rapgef6Q5NCJ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Rapgef6Q5NCJ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rapgef6Q5NCJ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rapgef6Q5NCJ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rapgef6Q5NCJ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Rapgef6Q5NCJ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rapgef6Q5NCJ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rapgef6Q5NCJ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rapgef6Q5NCJ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rapgef6Q5NCJ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rapgef6Q5NCJ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rapgef6Q5NCJ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rapgef6Q5NCJ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rapgef6Q5NCJ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rapgef6Q5NCJ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rapgef6Q5NCJ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rapgef6Q5NCJ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rapgef6Q5NCJ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rapgef6Q5NCJ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rapgef6Q5NCJ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Rapgef6Q5NCJ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms