Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prune2Q52KR3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prune2Q52KR3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prune2Q52KR3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prune2Q52KR3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prune2Q52KR3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prune2Q52KR3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prune2Q52KR3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prune2Q52KR3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prune2Q52KR3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune2Q52KR3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune2Q52KR3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune2Q52KR3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune2Q52KR3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune2Q52KR3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune2Q52KR3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prune2Q52KR3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms