Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnah12Q3V0Q1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnah12Q3V0Q1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnah12Q3V0Q1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnah12Q3V0Q1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnah12Q3V0Q1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnah12Q3V0Q1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnah12Q3V0Q1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnah12Q3V0Q1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnah12Q3V0Q1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnah12Q3V0Q1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnah12Q3V0Q1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnah12Q3V0Q1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnah12Q3V0Q1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dnah12Q3V0Q1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnah12Q3V0Q1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Dnah12Q3V0Q1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnah12Q3V0Q1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnah12Q3V0Q1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnah12Q3V0Q1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnah12Q3V0Q1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnah12Q3V0Q1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnah12Q3V0Q1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnah12Q3V0Q1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnah12Q3V0Q1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnah12Q3V0Q1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dnah12Q3V0Q1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnah12Q3V0Q1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms