Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Fchsd2Q3USJ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fchsd2Q3USJ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fchsd2Q3USJ8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fchsd2Q3USJ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fchsd2Q3USJ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fchsd2Q3USJ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fchsd2Q3USJ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fchsd2Q3USJ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fchsd2Q3USJ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fchsd2Q3USJ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fchsd2Q3USJ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fchsd2Q3USJ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Fchsd2Q3USJ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fchsd2Q3USJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fchsd2Q3USJ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fchsd2Q3USJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fchsd2Q3USJ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Fchsd2Q3USJ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fchsd2Q3USJ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fchsd2Q3USJ8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fchsd2Q3USJ8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fchsd2Q3USJ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fchsd2Q3USJ8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fchsd2Q3USJ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fchsd2Q3USJ8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fchsd2Q3USJ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fchsd2Q3USJ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fchsd2Q3USJ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fchsd2Q3USJ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fchsd2Q3USJ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fchsd2Q3USJ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fchsd2Q3USJ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fchsd2Q3USJ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fchsd2Q3USJ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fchsd2Q3USJ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fchsd2Q3USJ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fchsd2Q3USJ8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fchsd2Q3USJ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms