Protein–RNA interactions for Protein: Q3URQ4

Fam8a1, Family with sequence similarity 8, member A1, mousemouse

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam8a1Q3URQ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms