Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm20Q3UQS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm20Q3UQS8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm20Q3UQS8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbm20Q3UQS8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbm20Q3UQS8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbm20Q3UQS8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbm20Q3UQS8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rbm20Q3UQS8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rbm20Q3UQS8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm20Q3UQS8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm20Q3UQS8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm20Q3UQS8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm20Q3UQS8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm20Q3UQS8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbm20Q3UQS8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm20Q3UQS8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm20Q3UQS8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm20Q3UQS8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm20Q3UQS8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm20Q3UQS8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm20Q3UQS8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm20Q3UQS8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbm20Q3UQS8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm20Q3UQS8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm20Q3UQS8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm20Q3UQS8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm20Q3UQS8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm20Q3UQS8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm20Q3UQS8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbm20Q3UQS8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm20Q3UQS8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rbm20Q3UQS8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbm20Q3UQS8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms