Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam117bQ3U3E2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam117bQ3U3E2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam117bQ3U3E2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam117bQ3U3E2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam117bQ3U3E2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam117bQ3U3E2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam117bQ3U3E2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam117bQ3U3E2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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