Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem35bQ3U0Y2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem35bQ3U0Y2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem35bQ3U0Y2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem35bQ3U0Y2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmem35bQ3U0Y2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmem35bQ3U0Y2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmem35bQ3U0Y2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmem35bQ3U0Y2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem35bQ3U0Y2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem35bQ3U0Y2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmem35bQ3U0Y2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem35bQ3U0Y2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem35bQ3U0Y2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmem35bQ3U0Y2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem35bQ3U0Y2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmem35bQ3U0Y2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmem35bQ3U0Y2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem35bQ3U0Y2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem35bQ3U0Y2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem35bQ3U0Y2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem35bQ3U0Y2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem35bQ3U0Y2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms