Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUY3

Sbpl, Spermine-binding protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbplQ3TUY3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SbplQ3TUY3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SbplQ3TUY3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SbplQ3TUY3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SbplQ3TUY3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SbplQ3TUY3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SbplQ3TUY3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SbplQ3TUY3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SbplQ3TUY3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SbplQ3TUY3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SbplQ3TUY3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SbplQ3TUY3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SbplQ3TUY3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SbplQ3TUY3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SbplQ3TUY3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SbplQ3TUY3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SbplQ3TUY3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SbplQ3TUY3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SbplQ3TUY3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SbplQ3TUY3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SbplQ3TUY3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SbplQ3TUY3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SbplQ3TUY3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SbplQ3TUY3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SbplQ3TUY3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SbplQ3TUY3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SbplQ3TUY3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SbplQ3TUY3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SbplQ3TUY3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SbplQ3TUY3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SbplQ3TUY3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms